Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms