Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPECC1LQ69YQ0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPECC1LQ69YQ0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms