Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUPD1Q68J44 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUPD1Q68J44 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms