Protein–RNA interactions for Protein: Q68D06

SLFN13, Schlafen family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13Q68D06 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN13Q68D06 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN13Q68D06 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms