Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CREB3L3Q68CJ9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CREB3L3Q68CJ9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms