Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
CARMIL1Q5VZK9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
CARMIL1Q5VZK9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CARMIL1Q5VZK9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CARMIL1Q5VZK9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CARMIL1Q5VZK9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CARMIL1Q5VZK9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CARMIL1Q5VZK9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CARMIL1Q5VZK9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CARMIL1Q5VZK9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CARMIL1Q5VZK9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CARMIL1Q5VZK9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CARMIL1Q5VZK9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CARMIL1Q5VZK9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
CARMIL1Q5VZK9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CARMIL1Q5VZK9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
CARMIL1Q5VZK9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CARMIL1Q5VZK9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CARMIL1Q5VZK9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CARMIL1Q5VZK9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CARMIL1Q5VZK9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CARMIL1Q5VZK9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
CARMIL1Q5VZK9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CARMIL1Q5VZK9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CARMIL1Q5VZK9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CARMIL1Q5VZK9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CARMIL1Q5VZK9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
CARMIL1Q5VZK9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
CARMIL1Q5VZK9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CARMIL1Q5VZK9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CARMIL1Q5VZK9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CARMIL1Q5VZK9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CARMIL1Q5VZK9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CARMIL1Q5VZK9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
CARMIL1Q5VZK9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CARMIL1Q5VZK9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CARMIL1Q5VZK9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CARMIL1Q5VZK9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CARMIL1Q5VZK9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CARMIL1Q5VZK9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CARMIL1Q5VZK9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CARMIL1Q5VZK9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CARMIL1Q5VZK9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CARMIL1Q5VZK9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
CARMIL1Q5VZK9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CARMIL1Q5VZK9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CARMIL1Q5VZK9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
CARMIL1Q5VZK9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CARMIL1Q5VZK9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CARMIL1Q5VZK9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
CARMIL1Q5VZK9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CARMIL1Q5VZK9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CARMIL1Q5VZK9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CARMIL1Q5VZK9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CARMIL1Q5VZK9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms