Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM46CQ5VWP2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM46CQ5VWP2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.6 ms