Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTUD1Q5VV17 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD1Q5VV17 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUD1Q5VV17 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms