Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RIF1Q5UIP0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms