Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC18Q5T9S5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms