Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATAD3CQ5T2N8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATAD3CQ5T2N8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATAD3CQ5T2N8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATAD3CQ5T2N8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATAD3CQ5T2N8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATAD3CQ5T2N8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms