Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf220Q5T0J3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms