Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NHSL1Q5SYE7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms