Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQS7

SH2D4B, SH2 domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4BQ5SQS7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SH2D4BQ5SQS7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms