Protein–RNA interactions for Protein: Q5QJU3

ACER2, Alkaline ceramidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER2Q5QJU3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACER2Q5QJU3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ACER2Q5QJU3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms