Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRA6

MIA3, Transport and Golgi organization protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIA3Q5JRA6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MIA3Q5JRA6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIA3Q5JRA6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MIA3Q5JRA6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MIA3Q5JRA6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MIA3Q5JRA6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MIA3Q5JRA6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MIA3Q5JRA6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MIA3Q5JRA6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MIA3Q5JRA6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MIA3Q5JRA6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MIA3Q5JRA6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MIA3Q5JRA6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MIA3Q5JRA6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MIA3Q5JRA6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MIA3Q5JRA6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MIA3Q5JRA6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms