Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CT47A1Q5JQC4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47A1Q5JQC4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms