Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HERC4Q5GLZ8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.2 ms