Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AA4PQ58FG1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AA4PQ58FG1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AA4PQ58FG1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AA4PQ58FG1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AA4PQ58FG1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AA4PQ58FG1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AA4PQ58FG1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AA4PQ58FG1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AA4PQ58FG1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AA4PQ58FG1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AA4PQ58FG1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AA4PQ58FG1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AA4PQ58FG1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AA4PQ58FG1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AA4PQ58FG1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AA4PQ58FG1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AA4PQ58FG1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AA4PQ58FG1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms