Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL12Q53G59 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms