Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms