Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTXN3Q4LDR2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTXN3Q4LDR2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms