Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LONRF3Q496Y0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms