Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCQ8

TIMM50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50Q3ZCQ8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TIMM50Q3ZCQ8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms