Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms