Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRFIP1Q32MZ4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms