Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LONRF1Q17RB8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF1Q17RB8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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