Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTGISQ16647 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms