Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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