Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN9AQ15858 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN9AQ15858 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
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