Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3A2Q15428 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SF3A2Q15428 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms