Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PUM3Q15397 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PUM3Q15397 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PUM3Q15397 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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