Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
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