Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX17Q15036 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
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