Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCLAFQ15004 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms