Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSPNQ14714 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SSPNQ14714 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SSPNQ14714 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSPNQ14714 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSPNQ14714 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSPNQ14714 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSPNQ14714 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSPNQ14714 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSPNQ14714 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SSPNQ14714 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SSPNQ14714 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SSPNQ14714 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SSPNQ14714 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SSPNQ14714 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SSPNQ14714 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSPNQ14714 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSPNQ14714 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSPNQ14714 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SSPNQ14714 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SSPNQ14714 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSPNQ14714 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSPNQ14714 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SSPNQ14714 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSPNQ14714 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSPNQ14714 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSPNQ14714 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSPNQ14714 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSPNQ14714 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSPNQ14714 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSPNQ14714 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSPNQ14714 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSPNQ14714 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SSPNQ14714 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSPNQ14714 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSPNQ14714 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SSPNQ14714 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SSPNQ14714 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SSPNQ14714 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSPNQ14714 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SSPNQ14714 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SSPNQ14714 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SSPNQ14714 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSPNQ14714 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSPNQ14714 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSPNQ14714 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSPNQ14714 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSPNQ14714 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSPNQ14714 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SSPNQ14714 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSPNQ14714 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SSPNQ14714 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSPNQ14714 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SSPNQ14714 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSPNQ14714 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSPNQ14714 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSPNQ14714 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SSPNQ14714 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SSPNQ14714 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SSPNQ14714 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSPNQ14714 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SSPNQ14714 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSPNQ14714 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSPNQ14714 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSPNQ14714 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SSPNQ14714 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSPNQ14714 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.27■■□□□ 1
SSPNQ14714 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SSPNQ14714 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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