Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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