Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms