Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TOP3AQ13472 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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