Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATMQ13315 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATMQ13315 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATMQ13315 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATMQ13315 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATMQ13315 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATMQ13315 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATMQ13315 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATMQ13315 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATMQ13315 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATMQ13315 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATMQ13315 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATMQ13315 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATMQ13315 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATMQ13315 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATMQ13315 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATMQ13315 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATMQ13315 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATMQ13315 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATMQ13315 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATMQ13315 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATMQ13315 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATMQ13315 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATMQ13315 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATMQ13315 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATMQ13315 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATMQ13315 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATMQ13315 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATMQ13315 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATMQ13315 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATMQ13315 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATMQ13315 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATMQ13315 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATMQ13315 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATMQ13315 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATMQ13315 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATMQ13315 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATMQ13315 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATMQ13315 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATMQ13315 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATMQ13315 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATMQ13315 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATMQ13315 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATMQ13315 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATMQ13315 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATMQ13315 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATMQ13315 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATMQ13315 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATMQ13315 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATMQ13315 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATMQ13315 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATMQ13315 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATMQ13315 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATMQ13315 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATMQ13315 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATMQ13315 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATMQ13315 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATMQ13315 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATMQ13315 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATMQ13315 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATMQ13315 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATMQ13315 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATMQ13315 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATMQ13315 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATMQ13315 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATMQ13315 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATMQ13315 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATMQ13315 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATMQ13315 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATMQ13315 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATMQ13315 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATMQ13315 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATMQ13315 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATMQ13315 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATMQ13315 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATMQ13315 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATMQ13315 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATMQ13315 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATMQ13315 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATMQ13315 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATMQ13315 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATMQ13315 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATMQ13315 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATMQ13315 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATMQ13315 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATMQ13315 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATMQ13315 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATMQ13315 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATMQ13315 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATMQ13315 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATMQ13315 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATMQ13315 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATMQ13315 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATMQ13315 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATMQ13315 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATMQ13315 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATMQ13315 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATMQ13315 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATMQ13315 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATMQ13315 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms