Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN1Q12860 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN1Q12860 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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