Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 CPNE1-208ENST00000414711 673 ntTSL 517.42■□□□□ 0.383e-10■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 CPNE1-215ENST00000437100 826 ntTSL 515.21■□□□□ 0.033e-10■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 CPNE1-206ENST00000412056 998 ntTSL 314.44□□□□□ -0.13e-10■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 AL109827.1-202ENST00000441563 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 210.46□□□□□ -0.733e-10■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 AL109827.1-201ENST00000454607 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 210.46□□□□□ -0.733e-10■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 CPNE1-218ENST00000439806 748 ntTSL 59.97□□□□□ -0.813e-10■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 ZGPAT-211ENST00000484569 749 ntTSL 219.14■□□□□ 0.652e-6■□□□□ 10.9
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GRSF1Q12849 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.381e-8■□□□□ 10.9
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GRSF1Q12849 TMEM141-204ENST00000483187 683 ntTSL 216.04■□□□□ 0.161e-8■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.091e-8■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.375e-6■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.377e-12■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.171e-7■□□□□ 10.8
GRSF1Q12849 DGCR2-202ENST00000389262 4814 ntTSL 1 (best)13.99□□□□□ -0.171e-7■□□□□ 10.8
GRSF1Q12849 SGSH-213ENST00000575282 5562 ntTSL 1 (best)13.34□□□□□ -0.271e-7■□□□□ 10.8
GRSF1Q12849 SGSH-210ENST00000573150 2612 ntTSL 213.21□□□□□ -0.291e-7■□□□□ 10.8
GRSF1Q12849 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.321e-7■□□□□ 10.8
GRSF1Q12849 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.321e-7■□□□□ 10.8
GRSF1Q12849 DGCR2-205ENST00000537045 4361 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.531e-7■□□□□ 10.8
GRSF1Q12849 SGSH-209ENST00000572257 581 ntTSL 411.58□□□□□ -0.561e-7■□□□□ 10.8
GRSF1Q12849 SGSH-206ENST00000571156 554 ntTSL 411.18□□□□□ -0.621e-7■□□□□ 10.8
GRSF1Q12849 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.411e-15■□□□□ 10.8
GRSF1Q12849 SRRM2-217ENST00000573692 459 ntTSL 317.79■□□□□ 0.441e-15■□□□□ 10.8
GRSF1Q12849 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.381e-15■□□□□ 10.8
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GRSF1Q12849 SRRM2-202ENST00000570539 431 ntTSL 211.06□□□□□ -0.641e-15■□□□□ 10.8
GRSF1Q12849 SRRM2-216ENST00000573583 543 ntTSL 410.21□□□□□ -0.771e-15■□□□□ 10.8
GRSF1Q12849 ITGB5-205ENST00000474838 475 ntTSL 317.2■□□□□ 0.341e-8■□□□□ 10.8
GRSF1Q12849 ITGB5-210ENST00000496703 789 ntTSL 216.95■□□□□ 0.31e-8■□□□□ 10.8
GRSF1Q12849 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.561e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 ZDHHC18-204ENST00000488397 1275 ntTSL 213.61□□□□□ -0.231e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 TSG101-203ENST00000535077 685 ntTSL 321.23■□□□□ 0.991e-6■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 TSG101-210ENST00000545247 783 ntTSL 320.41■□□□□ 0.861e-6■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 TSG101-202ENST00000438874 581 ntTSL 1 (best)20.09■□□□□ 0.811e-6■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.671e-6■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 TSG101-209ENST00000544804 391 ntTSL 316.01■□□□□ 0.151e-6■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.11e-6■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.94e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 NTAN1-208ENST00000568320 667 ntTSL 220.5■□□□□ 0.874e-7■□□□□ 10.7
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GRSF1Q12849 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.874e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 NTAN1-206ENST00000567030 454 ntTSL 214.33□□□□□ -0.124e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 NTAN1-203ENST00000565187 1043 ntTSL 211.85□□□□□ -0.514e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 NTAN1-204ENST00000566419 738 ntTSL 37.8□□□□□ -1.164e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 NTAN1-202ENST00000563940 354 ntTSL 57.75□□□□□ -1.174e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.22e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.182e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.152e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 MGME1-204ENST00000463219 571 ntTSL 38.83□□□□□ -12e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 RNF31-203ENST00000491351 1804 ntTSL 524.18■■□□□ 1.463e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 RNF31-219ENST00000559882 554 ntTSL 423.91■■□□□ 1.423e-7■□□□□ 10.7
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GRSF1Q12849 RNF31-225ENST00000560875 550 ntTSL 421.21■□□□□ 0.993e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.213e-7■□□□□ 10.7
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GRSF1Q12849 RNF31-204ENST00000557878 574 ntTSL 414.71□□□□□ -0.053e-7■□□□□ 10.7
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GRSF1Q12849 RNF31-212ENST00000559308 559 ntTSL 512.53□□□□□ -0.43e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 RNF31-220ENST00000560071 576 ntTSL 512.49□□□□□ -0.413e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 RNF31-211ENST00000559275 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.733e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.082e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.062e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.982e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.882e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.722e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.672e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.442e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.32e-9■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.312e-9■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.362e-9■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 RBM10-203ENST00000377604 3747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.62e-9■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 CFAP97-204ENST00000503223 682 ntTSL 224.86■■□□□ 1.574e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.84e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 ATP5O-210ENST00000496044 673 ntTSL 216.98■□□□□ 0.314e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 ATP5O-207ENST00000487374 469 ntTSL 515.49■□□□□ 0.074e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.93□□□□□ -0.022e-8■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 ATP5O-208ENST00000491703 2839 ntTSL 213.92□□□□□ -0.184e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 TKFC-218ENST00000533853 460 ntTSL 312.64□□□□□ -0.391e-11■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 CFAP97-202ENST00000458385 4852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.644e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 ATP5O-209ENST00000495005 586 ntTSL 211□□□□□ -0.654e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 ATP5O-205ENST00000431254 583 ntTSL 210.46□□□□□ -0.734e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 ATP5O-201ENST00000290299 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.744e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 AP000311.1-201ENST00000429238 1078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.744e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 ATP5O-206ENST00000484627 157 ntTSL 1 (best)7.66□□□□□ -1.184e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.534e-7■□□□□ 10.7
GRSF1Q12849 TSG101-206ENST00000542488 304 ntTSL 52.9□□□□□ -1.952e-6■□□□□ 10.6
GRSF1Q12849 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.962e-10■□□□□ 10.6
GRSF1Q12849 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.412e-10■□□□□ 10.6
GRSF1Q12849 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.182e-10■□□□□ 10.6
GRSF1Q12849 FARP2-204ENST00000413432 6065 ntTSL 212.58□□□□□ -0.42e-10■□□□□ 10.6
GRSF1Q12849 UBE2K-207ENST00000513231 871 ntTSL 1 (best)25.34■■□□□ 1.659e-12■□□□□ 10.5
GRSF1Q12849 TFAP4-207ENST00000575672 1613 nt22.17■■□□□ 1.142e-7■□□□□ 10.5
GRSF1Q12849 UBE2K-206ENST00000510934 589 ntTSL 221.81■■□□□ 1.089e-12■□□□□ 10.5
GRSF1Q12849 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.939e-12■□□□□ 10.5
GRSF1Q12849 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.739e-12■□□□□ 10.5
GRSF1Q12849 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.549e-12■□□□□ 10.5
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