Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX4Q12846 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX4Q12846 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX4Q12846 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX4Q12846 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
STX4Q12846 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
STX4Q12846 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
STX4Q12846 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
STX4Q12846 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
STX4Q12846 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
STX4Q12846 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX4Q12846 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX4Q12846 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX4Q12846 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX4Q12846 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX4Q12846 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
STX4Q12846 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX4Q12846 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX4Q12846 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX4Q12846 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX4Q12846 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX4Q12846 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX4Q12846 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX4Q12846 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STX4Q12846 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STX4Q12846 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STX4Q12846 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STX4Q12846 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STX4Q12846 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STX4Q12846 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STX4Q12846 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STX4Q12846 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STX4Q12846 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STX4Q12846 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STX4Q12846 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STX4Q12846 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STX4Q12846 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX4Q12846 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX4Q12846 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX4Q12846 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX4Q12846 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX4Q12846 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX4Q12846 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX4Q12846 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX4Q12846 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX4Q12846 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX4Q12846 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX4Q12846 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX4Q12846 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX4Q12846 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX4Q12846 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX4Q12846 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX4Q12846 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX4Q12846 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX4Q12846 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX4Q12846 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
STX4Q12846 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX4Q12846 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX4Q12846 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX4Q12846 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX4Q12846 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX4Q12846 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX4Q12846 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX4Q12846 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX4Q12846 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX4Q12846 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
STX4Q12846 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX4Q12846 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX4Q12846 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX4Q12846 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX4Q12846 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX4Q12846 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX4Q12846 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
STX4Q12846 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX4Q12846 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX4Q12846 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX4Q12846 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX4Q12846 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX4Q12846 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
STX4Q12846 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX4Q12846 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX4Q12846 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX4Q12846 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX4Q12846 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX4Q12846 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX4Q12846 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX4Q12846 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX4Q12846 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX4Q12846 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
STX4Q12846 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX4Q12846 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX4Q12846 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX4Q12846 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX4Q12846 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX4Q12846 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STX4Q12846 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STX4Q12846 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STX4Q12846 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STX4Q12846 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STX4Q12846 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms