Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
HMGXB3Q12766 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
HMGXB3Q12766 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
HMGXB3Q12766 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
HMGXB3Q12766 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
HMGXB3Q12766 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
HMGXB3Q12766 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
HMGXB3Q12766 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
HMGXB3Q12766 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
HMGXB3Q12766 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
HMGXB3Q12766 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
HMGXB3Q12766 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
HMGXB3Q12766 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
HMGXB3Q12766 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC41.14■■■■■ 4.18
HMGXB3Q12766 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
HMGXB3Q12766 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC41.14■■■■■ 4.18
HMGXB3Q12766 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
HMGXB3Q12766 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
HMGXB3Q12766 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
HMGXB3Q12766 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC41.13■■■■■ 4.18
HMGXB3Q12766 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.18
HMGXB3Q12766 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
HMGXB3Q12766 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
HMGXB3Q12766 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC41.13■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC41.09■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC41.09■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.17
HMGXB3Q12766 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
HMGXB3Q12766 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
HMGXB3Q12766 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
HMGXB3Q12766 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
HMGXB3Q12766 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
HMGXB3Q12766 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
HMGXB3Q12766 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
HMGXB3Q12766 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
HMGXB3Q12766 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
HMGXB3Q12766 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
HMGXB3Q12766 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
HMGXB3Q12766 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
HMGXB3Q12766 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
HMGXB3Q12766 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
HMGXB3Q12766 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
HMGXB3Q12766 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
HMGXB3Q12766 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
HMGXB3Q12766 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC41.03■■■■■ 4.16
HMGXB3Q12766 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
HMGXB3Q12766 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
HMGXB3Q12766 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
HMGXB3Q12766 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
HMGXB3Q12766 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
HMGXB3Q12766 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
HMGXB3Q12766 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
HMGXB3Q12766 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
HMGXB3Q12766 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
HMGXB3Q12766 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC41■■■■■ 4.15
HMGXB3Q12766 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
HMGXB3Q12766 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC41■■■■■ 4.15
HMGXB3Q12766 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
HMGXB3Q12766 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC41■■■■■ 4.15
HMGXB3Q12766 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
HMGXB3Q12766 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC40.99■■■■■ 4.15
HMGXB3Q12766 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
HMGXB3Q12766 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
HMGXB3Q12766 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
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