Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 ISU2YOR226C 471 nt5.08□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 PRR1YKL116C 1557 nt5.08□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 NGL2YMR285C 1548 nt5.07□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 YDR132CYDR132C 1488 nt5.07□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 MST1YKL194C 1389 nt5.07□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 CUE2YKL090W 1332 nt5.07□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 SEH1YGL100W 1050 nt5.07□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 YHR022CYHR022C 771 nt5.07□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 OAZ1YPL052W 879 nt5.07□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 MRL1YPR079W 1146 nt5.07□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 PEX34YCL056C 435 nt5.07□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 CBP1YJL209W 1965 nt5.07□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 ADE4YMR300C 1533 nt5.07□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 LPL1YOR059C 1353 nt5.06□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 PUS1YPL212C 1635 nt5.06□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 YDL157CYDL157C 357 nt5.06□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 YDL241WYDL241W 372 nt5.06□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 LSM6YDR378C 261 nt5.06□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 BBP1YPL255W 1158 nt5.06□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 MET3YJR010W 1536 nt5.06□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 AFT1YGL071W 2073 nt5.06□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 MCM4YPR019W 2802 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 YAP1YML007W 1953 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 THP1YOL072W 1368 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 RGT1YKL038W 3513 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 APJ1YNL077W 1587 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 NIT2YJL126W 924 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 CSR1YLR380W 1227 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 PPA2YMR267W 933 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 DIA1YMR316W 1011 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 VAM3YOR106W 852 nt5.05□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 CTF18YMR078C 2226 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 YDR134CYDR134C 411 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 PHM8YER037W 966 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 GTO1YGR154C 1071 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 MHO1YJR008W 1017 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 RAD17YOR368W 1206 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 PCL8YPL219W 1479 nt5.04□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 SUM1YDR310C 3189 nt5.03□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 NGR1YBR212W 2019 nt5.03□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 MCM21YDR318W 1107 nt5.03□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 SPL2YHR136C 447 nt5.03□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 COX3Q0275 810 nt5.03□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 ATP12YJL180C 978 nt5.03□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 YLL017WYLL017W 312 nt5.03□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 RPC19YNL113W 429 nt5.03□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 YGP1YNL160W 1065 nt5.03□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 VPS28YPL065W 729 nt5.03□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 ISA2YPR067W 558 nt5.03□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 SNF3YDL194W 2655 nt5.03□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 FPK1YNR047W 2682 nt5.03□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 APL6YGR261C 2430 nt5.03□□□□□ -1.6
UBX3Q12229 MHR1YDR296W 681 nt5.02□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 MRPL25YGR076C 474 nt5.02□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 DAL3YIR032C 588 nt5.02□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 NCE103YNL036W 666 nt5.02□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 RPL3YOR063W 1164 nt5.02□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 UBS1YBR165W 834 nt5.02□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 SOG2YOR353C 2376 nt5.01□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 ROG3YFR022W 2202 nt5.01□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 STD1YOR047C 1335 nt5.01□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 ATG32YIL146C 1590 nt5.01□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 YIR007WYIR007W 2295 nt5.01□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 GLE2YER107C 1098 nt5.01□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 YGR122WYGR122W 1209 nt5.01□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 YIL028WYIL028W 399 nt5.01□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 YKR104WYKR104W 921 nt5.01□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 BUD14YAR014C 2130 nt5.01□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 YOL035CYOL035C 303 nt5.01□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 DSC2YOL073C 969 nt5.01□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 SMA1YPL027W 738 nt5.01□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 UGA1YGR019W 1416 nt5□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 UBA1YKL210W 3075 nt5□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 YJL193WYJL193W 1209 nt5□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 CTR3YLR411W 726 nt5□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 YOL050CYOL050C 321 nt5□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 YPL062WYPL062W 405 nt5□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 CST6YIL036W 1764 nt5□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 BRE2YLR015W 1518 nt4.99□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 IWR1YDL115C 1062 nt4.99□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 UBC6YER100W 753 nt4.99□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 YFL064CYFL064C 525 nt4.99□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 RPB4YJL140W 666 nt4.99□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 PRS1YKL181W 1284 nt4.99□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 NEJ1YLR265C 1029 nt4.99□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 SCW10YMR305C 1170 nt4.99□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 snR10snR10 245 nt4.99□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 YPR202WYPR202W 717 nt4.99□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 YCL041CYCL041C 495 nt4.99□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 HES1YOR237W 1305 nt4.98□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 ARO9YHR137W 1542 nt4.98□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 SAP155YFR040W 3009 nt4.98□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 PAU17YLL025W 375 nt4.98□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt4.98□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt4.98□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 ETT1YOR051C 1239 nt4.98□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 SER1YOR184W 1188 nt4.98□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 RMI1YPL024W 726 nt4.98□□□□□ -1.61
UBX3Q12229 YJR015WYJR015W 1533 nt4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.1 ms