Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPAL4Q0D2K0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms