Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F3Q08477 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4F3Q08477 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms