Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
GOLGA3Q08378 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC37.45■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
GOLGA3Q08378 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms