Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNB2Q08289 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms