Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SOS1Q07889 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SOS1Q07889 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms